STIKES  Muhammadiyah Kudus berubah bentuk menjadi Universitas Muhammadiyah Kudus (UMKU) sesuai SK KEMENRISTEKDIKTI Republik Indonesia Nomor : 879/KPT/I/2018 tertanggal 12 Oktober 2018. Universitas Muhammadiyah Kudus memiliki 11 (sebelas) Fakultas yaitu Fakultas Kebidanan, Fakultas Keperawatan, Fakultas Farmasi, Fakultas Kesehatan, Fakultas Gizi, Fakultas Ekonomi & Bisnis, Fakultas Hukum, Fakultas Komputer, Fakultas Keguruan & Pendidikan, Fakultas Teknik, dan Fakultas MIPA.

Fakultas Ekonomi & Bisnis didirikan sesuai dengan SK Badan Pembina Harian Universitas Muhammadiyah Kudus No 09/BPH-UMKU/X/2018 tertanggal 17 Oktober 2018. Fakultas Ekonomi & Bisnis Universitas Muhammadiyah Kudus mempunyai 3 (tiga) Program Studi antara lain Program Studi S-1 Ekonomi Syariah, Program Studi S-1 Teknik Akuntansi, Program Studi S-1 Bisnis Digital.